Ya pasó un año desde el "incidente Tachikawa" el verano de 2015. CROWDS (el sistema que convierte los pensamientos humanos en objetos físicos que Berg Katze le dio a Rui Ninomiya después de extraer su NOTE) ha llegado a las masas. El Primer Ministro Seitarou Sugayama regresa a su plan original, pero no todo mundo está de acuerdo con su política. Una misteriosa organización ataca el vehículo de Sugayama, lo que da inicio a una serie de conflictos.