Arikawa Yun, un joven genio de la informática, trabaja para una extraña empresa llamada Fábrica Outaki, quienes hacen de todo, desde arreglar cañerías a desarrollar robots. Cuando realizaba un trabajo, se topa con unas extrañas señales, las cuales lo llevan a un centro de observación de ondas radiales donde se encuentra Kamino Mei, estudiante de posgrado, quien va ahí como ayudante en lugar de su profesor. Es así como los dos se conocen y se enteran de que dichas señales son producidas por un monstruo gigante y ahora deberán luchar contra ellos.