Siguiendo donde la primera temporada acabó, el aumento repentino de Thanatos con la desaparición ahora de los Cazadores Aube ha dejado Arcadia en la ruina. Como la desesperación reina la Organización Religiosa lucha para combatir los Thanatos. Seis meses hace ya desde que la mansión Hidamari se quemara hasta las cenizas, los Cazadores Aube, una vez aclamados como héroes, ahora son culpados por las apariciones de los Thanatos. Sin embargo, la esperanza todavía existe para la reaparición del Huevo de la Reina algún día, quien se hará el salvador de Arcadia. Sin embargo desconocido a muchos, los Cazadores Aube en realidad han estado esperando silenciosamente el despertar de Angelique, quien ha estado dormida todo este tiempo.