El año en que un cometa recorre el aire, abriendo el cielo, desde las profundidades de la Tierra el dios oscuro se levantará de nuevo. Entonces las fuerzas malignas escondidas en las sombras saldrán del infierno y se mostrarán en el mundo. Las emociones del filo del viento se reunirán en la fuente de la luz azul, y los tres filos se harán uno, haciendo desaparecer la maldad.
Estamos en el año 1580, y los ejércitos malditos de Lord Nobunaga Oda se extienden sin cesar por todo Japón. Escapando por los pelos de la matanza de su clan, una joven ninja roba desde las sombras. Ella es Ayame, la única superviviente del clan Kasumi, y la daga que lleva es uno de los 3 filos místicos. A ella se unirán Sakon y Ryoma, ninjas renegados y dueños de la espada y la lanza sagradas. Estos guerreros de las sombras deben unir sus armas y habilidades para hacer cierta "La Profecía de las Espadas Encantadas", o de lo contrario morir en el intento...