Un día, Yomogi Asanaka, un estudiante de primer año en la escuela secundaria Fujiyokidai, se encuentra con un hombre misterioso llamado Gauma que dice ser un "usuario de kaiju".
La repentina aparición de un kaiju es seguida por la entrada del gigantesco robot Dynazenon. En el lugar equivocado en el momento equivocado están Yume Minami, Koyomi Yamanaka y Chise Asukagawa, quienes son arrastrados a la lucha contra el kaiju.